根据上海市的口腔诊所执业许可备案制度，下面是一般的办理流程：

填写申请表：下载并填写上海市口腔诊所执业许可备案申请表，填写必要的个人或法人代表信息。

准备申请材料：根据申请表中的要求，准备以下材料：

诊所基本信息：包括诊所名称、法人代表信息、位置、面积、联系方式等。

营业执照副本：提供诊所的营业执照副本复印件。

经营场所证明：提供诊所的租赁合同或产权证明等。

诊所环境卫生证明：提供诊所的环境卫生合格证明，可以是通过当地卫生部门颁发的检验合格证明。

医师执业资格证明：提供诊所医师的执业资格证明。

其他要求：根据当地具体要求，可能需要提供其他相关证明文件。

前往工商部门递交申请：将填写完整的申请表和准备好的申请材料提交到上海市工商行政管理部门，通常是所在地区的工商行政管理局。

审核与现场评估：工商行政管理部门将对申请材料进行审核，并根据需要安排现场评估。现场评估可能包括对诊所场所、设施、环境卫生、医师资质等的检查与评估。

缴纳相关费用：审核通过后，根据工商行政部门的要求，办理相关手续并缴纳相关费用，如申请费和年检费等。

获得执业备案证书：完成前述手续并缴费后，工商行政管理部门将颁发口腔诊所的执业备案证书，并交予诊所负责人。