在上海申请口腔诊所的营业执照时，一般需要按照以下流程进行：

准备材料：根据上海市营业执照申请要求，准备相关材料。通常包括：

申请表：填写并签署营业执照申请表。

法定代表人身份证明：法定代表人的身份证明文件复印件。

营业场所租赁合同或房产证明：若租赁场所，提供租赁合同；若自有场所，提供房产证明。

卫生许可证明：符合卫生部门要求的卫生许可证明。

技术负责人资格证书：负责医疗技术的人员需要提供相关资格证书。

提交申请：将准备好的申请材料提交至上海市工商行政管理局或相关机构。同时，缴纳相应的申请费用。

审核和核准：提交申请后，上海市工商行政管理局或相关机构会对申请材料进行审核。一旦材料审核通过，会颁发口腔诊所的营业执照。

需要注意的是，以上是一般流程，并且可能因地区和政策的不同而有所变化。在具体操作过程中，建议您与当地工商行政管理局或相关机构进行确认，以确保您了解和满足所有的申请要求和程序。