眼科诊所在申请开设时需要经过一系列的步骤和流程，具体如下：

确定开设诊所的地点：需要经过卫生行政部门进行审查批准。

准备相关材料：需要提交设置申请书、可行性论证报告、医疗机构建筑设计平面图和房屋租赁合同等，并填写《设置医疗机构申请书》。

提交申请：完成准备工作后，将申请材料提交给当地卫生行政部门。

等待审批：卫生行政部门会对申请进行审核，审核通过后会颁发《设置医疗机构批准书》。

进行机构设置：诊所的名称、地址、设备、所须药品以及诊疗科目等需要符合卫生行政部门制定的标准。

执业登记：领取《设置医疗机构批准书》后，需要填写医疗机构管理登记备案书等，进行医疗机构执业登记。