眼科诊所有以下办理流程：

首先，需要准备医疗机构执业登记申请材料，包括诊所的名称、地址、注册资金、诊疗范围等，并提交给卫生行政部门进行预审核。在准备这些材料时，需要考虑诊所的定位，例如规模大小、服务对象等，确定合适的诊疗范围。

预审核通过后，需要领取设置医疗机构批准书和医疗机构执业许可证。在领取许可证之前，需要招聘合格的医生和护士，并制定医疗规章制度，包括医疗质量管理、医疗纠纷处理等。此外，需要装修诊所环境，确保诊所的环境、设施、设备等符合卫生和安全标准。

在装修完成后，需要提交工商营业执照的申请资料，包括诊所的名称、地址、投资人和诊疗范围等资料。当地市场监督管理局或相关工商部门会进行审核，审核通过后即可领取工商营业执照。

总的来说，眼科诊所的办理流程包括预审核、领取设置医疗机构批准书和许可证、装修环境、提交工商营业执照申请资料等步骤。