上海口腔诊所执业许可备案的流程如下：

准备申请材料：根据上海市卫生健康委员会的规定，准备申请材料，包括：申请表、法定代表人身份证明、营业执照、诊所环境平面图、所有执业人员（牙医）的相关证书和身份证明、设备清单等。

联系卫生健康委员会：将准备好的申请材料提交给上海市卫生健康委员会，并联系该委员会确定具体的备案流程和要求。

材料审核：卫生健康委员会对提交的申请材料进行审核，核实申请材料的真实性和完整性。

现场检查：如果需要，卫生健康委员会可能会派员进行现场检查，以核实诊所的设施、设备和卫生条件是否符合要求。

审批与备案：经过审核和现场检查后，卫生健康委员会会根据申请材料的真实性和符合要求程度，进行审批并发放执业许可证，同时将诊所信息纳入备案系统。